Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms