Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrnb2Q9ERK7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms