Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sil1Q9EPK6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms