Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r53Q9EP93 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms