Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms