Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn3Q9DCB1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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