Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne8Q9DC53 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms