Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CrotQ9DC50 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CrotQ9DC50 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms