Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmg20aQ9DC33 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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