Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pop5Q9DB28 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop5Q9DB28 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms