Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cab39lQ9DB16 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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