Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cnn3Q9DAW9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms