Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Efhc1Q9D9T8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Efhc1Q9D9T8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms