Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Borcs5Q9D920 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms