Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chmp4bQ9D8B3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms