Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl40Q9D783 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klhl40Q9D783 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms