Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttc9bQ9D6E4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttc9bQ9D6E4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms