Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930513O06RikQ9D549 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930513O06RikQ9D549 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms