Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syce1Q9D495 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms