Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Lrrc71Q9D3W5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Lrrc71Q9D3W5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc71Q9D3W5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms