Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9D3J9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms