Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Krt20Q9D312 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Krt20Q9D312 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Krt20Q9D312 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt20Q9D312 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms