Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms