Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SarnpQ9D1J3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms