Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mrpl28Q9D1B9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Mrpl28Q9D1B9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mrpl28Q9D1B9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Mrpl28Q9D1B9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Mrpl28Q9D1B9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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