Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms