Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm12Q9D0R8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms