Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms