Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp11Q9CZJ1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms