Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bud23Q9CY21 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bud23Q9CY21 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms