Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms