Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms