Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Exo5Q9CXP9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Exo5Q9CXP9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Exo5Q9CXP9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Exo5Q9CXP9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Exo5Q9CXP9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Exo5Q9CXP9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Exo5Q9CXP9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo5Q9CXP9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms