Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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Sgo1Q9CXH7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sgo1Q9CXH7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sgo1Q9CXH7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sgo1Q9CXH7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sgo1Q9CXH7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sgo1Q9CXH7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sgo1Q9CXH7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sgo1Q9CXH7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Sgo1Q9CXH7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Sgo1Q9CXH7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Sgo1Q9CXH7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Sgo1Q9CXH7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sgo1Q9CXH7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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