Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpainQ9CWY9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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RpainQ9CWY9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms