Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufaf1Q9CWX2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufaf1Q9CWX2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufaf1Q9CWX2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufaf1Q9CWX2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms