Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms