Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Cnot11Q9CWN7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Cnot11Q9CWN7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Cnot11Q9CWN7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnot11Q9CWN7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Cnot11Q9CWN7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cnot11Q9CWN7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cnot11Q9CWN7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Cnot11Q9CWN7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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