Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx2Q9CWK8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms