Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smurf1Q9CUN6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smurf1Q9CUN6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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