Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930535I16RikQ9CUI2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms