Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sft2d3Q9CSV6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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