Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CR55 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CR55 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CR55 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CR55 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CR55 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CR55 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CR55 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CR55 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CR55 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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