Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Atg12Q9CQY1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms