Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms