Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer1Q9CQL2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms