Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb5Q9CQH3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms