Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nudt21Q9CQF3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms