Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQC3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CQC3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQC3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms