Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms